二者的语法结构是不同的，英语的基本语法结构为主语+谓语+宾语或者主语+系动词+表语，Are you a Chinese?这是一个主系表结构。Do you have any question?这是一个主谓宾结构。

两者的不同用法

用Do，也就是助动词提问的问句，后面接的是动词，用Are也就是be动词提问的问句，后面接的是形容词，名词。 do是助动词，所谓助动词，顾名思义就是帮助动词的，那么用do提问，句中要有动词be是系词，用于构成主系表结构和进行时态。

Do you know Mr.Brown?

Did you have an English book?

Are you a teacher?

do是没有实际意义的，也就是我们平时说的助动词。而are是有实义的系动词。

Are you a student?这句话中，you是主语，is是系动词，student是表语，构成主系表结构的句子。Do you a student，这句话成分不全。而系动词与动词原形是不可以在一个完整的句子里同时出现的。所以不能are you live here(are是系动词，live为动词原形)。只能用do做助词来组成疑问句。